در راستای ارتقاء سطح علمی دانشجویان و دانش‌آموزان، معاونت امور آموزشی و پژوهشی بنیاد فرهنگی مصلّی‌نژاد، به طور پیوسته برنامه‌هایی نظیر حمایت از برگزاری سمینارها، کنفرانس‌ها و همایش‌های علمی و نیز چاپ کتب معتبر علمی نخبگان را تحت حمایت دارد و کمک هزینه برگزاری این برنامه‌ها و هم‌چنین فعالیت‌هایی نظیر انتشار مقالات علمی در نشریات معتبر را پرداخت می‌نماید.